櫻田純,一名不願上學而長期宅在家裏的中學生,熱衷于上網購物,并喜歡在購買物品後的退貨限期内退回物品。某天他收到一封奇怪的信,上面寫着“上發條還是不上發條”的選項,純在好奇心驅使下選擇了“上發條”,之後房間裏憑空出現了一隻沒有署名的神秘皮箱,裏面裝着一個非常美麗而且質感近似真人的少女人偶。使用木箱内的發條轉動背部的開關後,人偶竟像有生命般活動起來,并向純介紹自己:“我是真紅,薔薇少女的第五人偶。”這時,小醜布偶突然前來襲擊,純在在不明白怎麽回事的情況下莫名其妙地成爲了真紅的媒介,結下了主仆關系。之後,另一對結下類似契約的人類和人偶出現在純和真紅面前,被稱爲Rozen Maiden(薔薇少女) 的人偶們的戰鬥就此展開了……
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